Table of DH genes and amino acid conversion in each RF

Click to download a word version

Translation of the 34 germline DH genes in all 6 possible RF. SC are found in only 30% of the forward translations.

Forward

Inverted

1

2

3

1

2

3

D1-1*01

GTTGT

VQLER

YNWND

VVPVV

SFQLY

RSSCT

D1-14*01

GITGT

V*PEP

YNRNH

VVPVI

WFRLY

GSGYT

D1-20*01

GITGT

V*LER

YNWND

VVPVI

SFQLY

RSSYT

D1-26*01

GIVGAT

V*WELL

YSGSYY

VVAPTI

**LPLY

SSSHYT

D1-7*01

GITGT

V*LEL

YNWNY

VVPVI

*FQLY

SSSYT

D2-15*01

RIL*WW*LLL

GYCSGGSCYS

DIVVVVAAT

GVAATTTTIS

E*QLPPLQYP

SSSYHHYNI

D2-2*01

RIL**YQLLC

GYCSSTSCYA

DIVVVPAAM

GIAAGTTTIS

A*QLVLLQYP

HSSWYYYNI

D2-2*02

RIL**YQLLY

GYCSSTSCYT

DIVVVPAAI

GIAAGTTTIS

V*QLVLLQYP

YSSWYYYNI

D2-2*03

WIL**YQLLC

GYCSSTSCYA

DIVVVPAAM

GIAAGTTTIS

A*QLVLLQYP

HSSWYYYNI

D2-21*01

SILWW*LLF

AYCGGDCYS

HIVVVIAI

GIAITTTIC

E*QSPPQYA

NSNHHHNM

D2-21*02

SILWW*LLF

AYCGGDCYS

HIVVVTAI

GIAVTTTIC

E*QSPPQYA

NSSHHHNM

D2-8*01

RILY*WCMLY

GYCTNGVCYT

DIVLMVYAI

GIAYTISTIS

V*HTPLVQYP

YSIHH*YNI

D2-8*02

RILYWWCMLY

GYCTGGVCYT

DIVLVVYAI

GIAYTTSTIS

V*HTPPVQYP

YSIHHQYNI

D3-10*01

VLLWFGELL*

YYYGSGSYYN

ITMVRGVII

VIITPRTIVI

L**LPEP**Y

YNNSPNHSN

D3-10*02

VLLCSGSYYN

YYYVRGVII

ITMFGELL*

VIITPRT**Y

L**LPEHSN

YNNSPNIVI

D3-16*01

VL*LRLGELCLY

YYDYVWGSYAYT

IMITFGGVMLI

GISITPPNVIII

V*A*LPQT*S*Y

YKHNSPKRNHN

D3-16*02

VL*LRLGELSLY

YYDYVWGSYRYT

IMITFGGVIVI

GITITPPNVIII

V*R*LPQT*S*Y

YNDNSPKRNHN

D3-22*01

VLL***WLLL

YYYDSSGYYY

ITMIVVVIT

VVITTTIIVI

***PLLS**Y

SNNHYYHSN

D3-3*01

VLRFLEWLLY

YYDFWSGYYT

ITIFGVVII

GIITTPKIVI

V**PLQKS*Y

YNNHSKNRN

D3-3*02

VLAFLEWLLY

Y*HFWSGYYT

ISIFGVVII

GIITTPKMLI

V**PLQKC*Y

YNNHSKNAN

D3-9*01

VLRYFDWLL*

YYDILTGYYN

ITIF*LVII

VIITSQNIVI

L**PVKIS*Y

YNNQSKYRN

D4-11*01

*LQ*L

DYSNY

TTVT

VVTVV

*LL*S

SYCS

D4-17*01

*LR*L

DYGDY

TTVT

VVTVV

*SP*S

SHRS

D4-23*01

*LRW*L

DYGGNS

TTVVT

GVTTVV

ELPP*S

SYHRS

D4-4*01

*LQ*L

DYSNY

TTVT

VVTVV

*LL*S

SYCS

D5-12*01

VDIVATI

WI*WLRL

GYSGYDY

VIVATIS

*S*PLYP

NRSHYIH

D5-18*01

VDTAMV

WIQLWL

GYSYGY

VTIAVS

*P*LYP

NHSCIH

D5-24*01

VEMATI

*RWLQL

RDGYNY

VIVAIS

*L*PSL

NCSHLY

D5-5*01

VDTAMV

WIQLWL

GYSYGY

VTIAVS

*P*LYP

NHSCIH

D6-13*01

GYSSSWY

GIAAAG

V*QQLV

VPAAAIP

YQLLLY

TSCCYT

D6-19*01

GYSSGWY

GIAVAG

V*QWLV

VPATAIP

YQPLLY

TSHCYT

D6-25*01

GYSSGY

GIAAA

V*QRL

VAAAIP

*PLLY

SRCYT

D6-6*01

EYSSSS

SIAAR

V*QLV

GRAAIL

DELLY

TSCYT

D7-27*01

LTG

*LG

NWG

SPV

PQL

PS*